药食同源蔬菜赤苍藤SCoT分子标记体系的优化及引物筛选
杨天为1
黄诗宇1
张尚文1
高曼熔2
张向军1
李婷1
庾韦花1
蒙平1
石前1
1.广西壮族自治区农业科学院生物技术研究所 南宁 5300072.广西大学农学院 南宁 530004
摘要:笔者以24份不同来源地的野生赤苍藤种质为试验材料,采用L9(33)正交试验对赤苍藤SCoT-PCR反应体系进行优化,并通过优化后的体系进行引物筛选,结果表明,PCR体系中各因素对多态性结果的影响程度排序为DNA模板量>引物用量>2×Taq Master Mix用量.最佳反应体系(20μL)为1μL DNA模板(50 ng·μL-1)、1.2μL引物(10μmoL·μL-1)、10μL 2×Taq Master Mix和7.8μL ddH2O.通过该体系从36条SCoT引物中筛选出14条稳定性好、多态性高的引物,并确定了最佳退火温度.该体系的建立和引物的筛选将为后续开展赤苍藤种质资源收集与保护、遗传多样性研究和分子育种提供参考依据.
关键词:赤苍藤SCoT-PCR体系优化引物筛选
分类号:S567.1+9(经济作物)
资助基金:广西重点研发计划(AB21220042)广西农业科学院基本科研业务专项(2017YM27)广西农业科学院基本科研业务专项(2022JM51)广西特色作物试验站广西隆安中草药试验站(TS2022002)广西水土保持学会重点领域创新项目(202009001)
论文发表日期:2023-01-05
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:5( 48-52 )
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