89份西瓜种质资源表型鉴定和遗传多样性分析
康旗帅
闫梦苑
袁伟格
豆峻岭
杨森
刘东明
牛欢欢
闫文凯
朱华玉
杨路明
河南农业大学园艺学院 郑州 450002
摘要：以89份西瓜种质资源为材料,利用形态学标记和西瓜SNP高效液相芯片,结合多样性分析、群体结构分析、聚类分析和主成分分析等方法,对其遗传多样性进行系统全面的研究.结果表明,49个表型性状Shannon多样性指数的变化范围是0.42～3.00,平均值为2.32,其中描述型性状平均值为1.28,数量性状为2.82;33个数量性状的变异系数变化范围为5.45％～72.59％,平均值为28.00％,变异系数最大的是果实质量(72.59％),其次是第一雌花节位(64.21％)和第一雄花节位(58.59％).利用液相芯片对这89份种质资源进行DNA测序,得到60.2 Gb的原始数据和401.3 Mb的raw reads数据,质控后得到53.1 Gb的数据和399.7 Mb的clean reads数据,比对到参考基因组上的reads数为332.4 Mb,平均比对率为82.97％,平均测序深度为923.7 X.群体结构分析显示89份材料的最优群体结构数为2,主成分分析和系统发育树结果显示,在89份材料中,药西瓜与饲用西瓜亲缘关系最近,栽培西瓜与饲用西瓜亲缘关系次之.长期的选择驯化使西瓜遗传背景变得十分狭窄,通过发掘野生西瓜资源,进而拓宽西瓜遗传背景,对西瓜抗病、抗逆以及株型改良等分子育种具有重要意义.
关键词：西瓜种质资源群体结构分析
分类号：S651(瓜果园艺)
资助基金：国家自然科学基金(32172602)国家自然科学基金(32172574)国家自然科学基金(32102389)河南省农业良种联合攻关项目(2022010503)河南省重大科技专项(221100110400)河南省科技攻关项目(242102111124)
论文发表日期：2024-04-05
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：13( 14-26 )
英文信息