番茄SlMYB48基因生物信息学及表达分析
刘佳凤1
郭晓青2
王桂强3
王虹云4
朱桐1
曹守军4
姚建刚4
张丽莉4
张瑞清4
赵婧1
李涛5
1.烟台大学生命与科学学院 山东烟台 2640002.烟台市农业技术推广中心 山东烟台 2654993.招远市张星镇农业综合服务中心 山东招远 2654034.山东省烟台市农业科学研究院 山东烟台 2645005.烟台大学生命与科学学院 山东烟台 264000;山东省烟台市农业科学研究院 山东烟台 264500
摘要：MYB转录因子是植物转录因子家族中数量最多、用途最广的成员之一,为挖掘更多番茄(Solanum lycopersi-cum)MYB转录因子家族成员信息,初步探究其表达模式及功能,以番茄AilsaCraig为试材,采用RT-PCR的方法克隆SlMYB48基因,并对其进行生物信息学及表达、定位分析.结果表明,番茄SlMYB48基因的开放阅读框(ORF)长度为708 bp,编码235个氨基酸,在番茄的根中表达量最高,叶中次之.S1MYB48蛋白含有保守的MYB结构域,定位于细胞核中,属于不稳定、亲水性蛋白.对SlMYB48启动子分析,发现其含有大量的逆境响应元件,qRT-PCR及RNA-seq数据库分析结果表明,高盐、生物逆境胁迫条件下,SlMYB48基因表达量均随处理时间延长而升高,干旱胁迫条件下表达量下降,推测其可能参与番茄生物及非生物逆境胁迫反应.研究结果为进一步深入探究番茄SlMYB48基因的功能及作用机制提供了参考.
关键词：番茄SlMYB48表达分析定位
分类号：S641.2(园艺)
资助基金：烟台市科技计划项目(2022XCZX091)现代农业产业技术体系(CARS-23-G11)重庆市巫山县科技项目(wskjdx-bxm2023004)国家自然科学基金(32372737)国家重点实验室开放基金(SKL-KF202224)
论文发表日期：2024-04-05
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 27-35 )
英文信息