基于SCoT分子标记的61份加工型黄瓜种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建
王宏利1
赵久成1
赖淼1
卢家仕2
凌启昌1
肖锦华3
张华4
付鑫锋1
1.广西农业科学院钦州分院·钦州市农业科学研究所 广西钦州 5350002.广西农业科学院花卉研究所 南宁 5300073.钦州市钦南区那彭镇农业农村服务中心 广西钦州 5350154.钦州市浦北县北通镇农业农村服务中心 广西浦北 535321
摘要：为探明加工型黄瓜种质资源的亲缘关系及遗传多样性,为新品种选育提供理论依据,采用目标起始密码子多态性标记(SCoT)技术,以61份加工型黄瓜种质资源为试验材料,进行遗传多样性分析并构建DNA指纹图谱.结果表明,从100条SCoT引物中筛选出8条扩增条带清晰、多态性高且重复性好的引物;利用筛选出的引物对61份黄瓜种质基因组DNA进行PCR扩增,共扩增出238个位点信息,其中多态性位点227个,平均多态性位点百分比为95.38％;采用NTSYS-pc2.1软件计算得出供试的61份材料间的遗传相似系数分布在0.588～0.920之间,遗传相似系数最小的材料分别是34号与55号,二者在瓜色、叶片形状及果实形状方面存在较大差异,说明两者亲缘关系最远.基于遗传相似系数对其进行UPGMA聚类分析和树状图绘制,在相似系数0.735处,可将其划分为7个类群,说明61份黄瓜种质材料背景存在差异,但多数地域来源相近、生境相似地区的种质被聚在同一类群.利用2对特异性较大的引物SCoT 12和SCoT 83构建的DNA指纹图谱可单独鉴别出61份黄瓜种质资源,该图谱可为黄瓜分类与鉴定提供科学依据.
关键词：黄瓜SCoT分子标记亲缘关系遗传多样性DNA指纹图谱
分类号：S642.2(园艺)
资助基金：广西壮族自治区科技先锋队强农富民六个一专项行动项目(20230505)
论文发表日期：2024-04-05
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：10( 36-45 )
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