西瓜ClKNOX基因家族全基因组鉴定及组织表达分析
陈雅心
户奥锋
张力铭
刘权权
杨路明
朱华玉
刘东明
河南农业大学园艺学院 郑州 450046
摘要：KNOX基因家族是编码同源异型盒蛋白的转录因子,在植物生长发育和胁迫响应中发挥着重要的调控作用.为进一步挖掘西瓜KNOX转录因子家族成员信息,探究分析其表达模式及基因功能,通过生物信息学方法对西瓜KNOX基因家族成员进行了鉴定,并对其理化性质、基因结构、系统进化及表达模式进行了分析.结果表明,西瓜基因组中共有12个KNOX基因,均定位于细胞核中,符合转录因子属性特征;KNOX1、KNOX2、ELK和Homeo-box KN这4类典型结构域均存在于大多数西瓜KNOX基因中,表明这4类结构域在KNOX基因功能中具有重要作用;系统发育分析将ClKNOX基因家族成员分为Class ⅠA、Class Ⅰ B、Class ⅡA和Class Ⅱ B4个亚组,启动子元件分析表明,ClKNOX基因家族含有较多与生长发育和胁迫响应相关的顺式作用调控元件;组织表达分析结果表明,ClKNOX基因具有明显的组织特异表达特性,ClKNOX6和ClKNOX11在根和茎中高表达,而ClKNOX3和ClKNOX10在所有器官中表达量都相对较高,但所有ClKNOX基因在果肉中的相对表达量都较低.研究结果为进一步深入探究ClKNOX基因在生长发育中的功能和组织表达特性奠定了基础.
关键词：西瓜KNOX基因家族全基因组鉴定生物信息学分析组织表达
分类号：S651(瓜果园艺)
资助基金：河南省科技攻关项目(222102110124)河南省农业品种改良联合研究项目(2022010503)
论文发表日期：2024-05-05
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：10( 18-27 )
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