西瓜TALE基因家族鉴定及表达分析
陈筱瑶1
冯梦娇1
黄欣1
张瑞青1
代雪1
王家发1
张显1
李军华2
霍治邦2
魏春华1
1.西北农林科技大学园艺学院 陕西杨凌 7121002.开封市农林科学研究院 河南开封 475004
摘要：TALE基因家族在调控花器官发育、花分生组织形成、器官形态发生、果实发育、植物非生物胁迫响应及激素响应中发挥重要作用.利用生物信息学的方法鉴定了西瓜TALE基因家族成员,并分析了其基因结构、系统发育树、保守基序、顺式作用元件、组织特异性表达,以及低温胁迫和干旱胁迫后基因的表达情况,为西瓜TALE基因家族的功能研究和利用提供了理论依据.结果表明,西瓜TALE基因家族共包含19个成员.系统发育分析将ClTALE家族分为BEL1-like和KNOX两个亚家族,KNOX亚家族又可进一步划分为两个分支Class Ⅰ和Class Ⅱ.顺式作用元件分析表明,ClTALE基因的启动子中富含光、植物激素和非生物胁迫响应的顺式元件,其中光响应元件最多.西瓜组织特异性表达分析表明,ClBLH09在根中高表达,ClBLH01在卷须、雌花和雄花中高表达,因此西瓜TALE基因家族可能参与了西瓜的生长发育过程.低温胁迫(0、3、6、12、24、36和48 h)和干旱胁迫(0、1、2、3、4、5、6、7和8 d)不同时间后基因的表达分析表明,ClBLH08和ClKN02在低温胁迫下呈现上调趋势,ClBLH04和ClBLH05在干旱胁迫下呈上调的趋势,因此西瓜TALE基因家族可能在低温胁迫和干旱胁迫中发挥作用.
关键词：西瓜TALE基因家族生物信息学表达分析
分类号：S651(瓜果园艺)
资助基金：西北农林科技大学种业创新专项(2452022116)现代农业产业技术体系建设专项(CARS-25)杨凌种业创新中心重点研发项目(Ylzy-sc-01)
论文发表日期：2024-10-05
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：12( 18-29 )
英文信息