西瓜NPR基因家族的鉴定及其在盐胁迫下的表达分析
贾云鹤
黑龙江省农业科学院园艺分院 哈尔滨 150069
摘要：以拟南芥NPR基因家族成员蛋白序列为查询序列,在西瓜基因组数据库中鉴定西瓜NPR基因家族成员,并对其进行生物信息学分析及盐胁迫下的表达分析.共鉴定到4个成员,将其命名为ClNPR1～ClNPR4,其编码蛋白的理化性质、保守功能结构域、重要氨基酸残基及motif分析结果与其他物种有较高的一致性,顺式作用元件分析显示,ClNPRs与非生物胁迫相关.300mmol·L-1NaCl处理耐盐材料和盐敏感材料,分别取盐胁迫0、8、24h的叶片进行4个NPR基因的表达模式分析,结果表明,ClNPR1在盐敏感和耐盐材料中都显著上调表达,但盐胁迫24h,ClNPR1在盐敏感材料中显著下调表达,在耐盐材料中虽然下调但还保持较高的表达水平,且在耐盐材料中的表达量显著高于盐敏感材料;盐胁迫24h,ClNPR2和ClNPR3在盐敏感和耐盐材料中都显著上调表达,在耐盐材料中的表达量均显著高于盐敏感材料.推测ClNPRs基因在西瓜响应盐胁迫的过程中扮演重要角色.
关键词：西瓜NPR家族蛋白盐胁迫表达
分类号：S651(瓜果园艺)
资助基金：黑龙江省重点研发计划(SC2022ZX02C0202)国家西甜瓜产业技术体系项目(CARS-25)黑龙江省农业科技创新跨越工程项目(CX23GG05)
论文发表日期：2025-01-04
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 16-24 )
英文信息