淹水胁迫下甜瓜幼苗的转录组测序及生物信息学分析
王亚楠
姜艳芳
刘泽发
党建成
张红磊
张紫霞
湖南人文科技学院 湖南娄底 417000
摘要：涝害是全球范围内危害最广、频率最高的自然灾害.葫芦科瓜类作物耐涝性较差,尤其是甜瓜.甜瓜属一年生草本葫芦科植物,喜温热气候,对涝湿环境耐受能力较弱,是我国重要经济作物.甜瓜种植区域遭受持续多雨或者涝灾的影响,可能会导致减产甚至绝收.以实验室甜瓜耐涝种间杂交高代种M13-06-3为试材,对其进行淹水胁迫,并利用转录组测序及实时荧光定量PCR对其根系组织进行差异表达基因分析.结果表明,淹水胁迫后,耐涝型甜瓜品种M13-06-3筛选出9037个差异表达基因,其中4529个DEGs上调,4508个DEGs为下调基因.通过实时荧光定量检测发现 MELO3C003917、MELO3C020588、MELO3C008314、MELO3C025360、MELO3C021658 这 5 个基因定量检测数据与转录组数据的趋势基本一致,初步推测这5个基因为甜瓜耐涝基因.研究结果可为进一步挖掘与甜瓜耐涝相关的基因奠定基础.
关键词：甜瓜淹水胁迫实时荧光定量PCRRNA高通量测序技术差异表达基因
分类号：S652(瓜果园艺)
资助基金：湖南省教育厅科学研究项目(22C0594)
论文发表日期：2025-06-05
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：12( 14-25 )
英文信息