基于数学模型的药物成分肾毒性预测
王新洲1
朱永亮1
金若敏2
刘敬阁1
钱向平3
姚广涛2
叶祖光4
1.苏州润新生物科技有限公司,苏州2151232.上海中医药大学药物安全评价研究中心,上海2012033.苏州润新生物科技有限公司,苏州215123;苏州大学,苏州2151234.中国中医科学院中药研究所,北京100700
摘要:目的:探索使用定量结构-活性关系(quantitative structure-activity relationship,QSAR)模型预测中药成分肾毒性.方法:从西药不良反应数据库(side effect resource,SIDER)收集得到了876个化合物(有肾毒不良反应记录的344个,无肾毒不良反应记录的532个),在对其描述符计算、挑选后,利用k近邻算法和支持向量机算法进行模型构建,然后用22个中药成分作为外部测试集进行模型验证评价.结果:利用k近邻算法当参数k为l时构建的模型对有肾毒数据集具有较好的预测能力,其对外部测试集中有肾毒成分的预测准确率也最高,达到64.29%.支持向量机算法构建的模型虽然有较高的自身预测准确率(80.25%),但是其对外部测试集的预测准确率仅有45.45%.结论:采用k近邻算法构建的模型对外部测试集22个中药成分具有较好的预测能力.
关键词:肾毒预测定量结构-活性关系k近邻算法支持向量机算法
分类号:R913(药物基础科学)
论文发表日期:2014-01-01
在线出版日期:2026-08-14(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
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中国新药杂志

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北大核心CSTPCD
ISSN:1003-3734
年,卷(期):2014,23(13)
所属栏目:实验研究