三氯叔丁醇影响缩宫素在溶液中分布行为的分子模拟
徐亦奇1
吴彦霖2
孟凡翠3
任玉1
谭德讲2
梅玫1
1.天津医科大学基础医学院,天津,3000702.中国食品药品检定研究院化学药品检定所,北京,1000503.天津药物研究院释药技术与药代动力学国家重点实验室,天津市新药设计与发现重点实验室,天津300193
摘要:目的:利用分子动力学(molecular dynamic,MD)模拟方法研究三氯叔丁醇对缩宫素在水溶液中分布行为的影响.方法:以Schrsdinger软件构建不同数量缩宫素和三氯叔丁醇与7 500个水分子的5个体系,以AMBERTOOL12设置体系力场参数,以Gromacs软件采用AMBER03力场进行10 ns的NVT模拟,记录模拟轨迹,计算均方位移(MSD)、扩散系数、氢键、相互作用残基等参数.结果:缩宫素在水中是一种逐步聚集的动态过程,500个三氯叔丁醇对10个缩宫素分散良好,增加三氯叔丁醇到1 000个分子可以导致缩宫素在三氯叔丁醇相中聚集.水中缩宫素参与聚集的氨基酸随机性较大,在三氯叔丁醇相中的聚集为首尾相互作用.三氯叔丁醇的加入可以降低缩宫素与水氢键相互作用.结论:缩宫素在水中有自聚的倾向,在适当浓度下三氯叔丁醇具有明显的分散作用.
关键词:缩宫素三氯叔丁醇分子动力学模拟分散作用
分类号:R943.42(药剂学)R979.1(药品)
资助基金:重大新药创制"科技重大专项(2015ZX09303001)国家自然科学基金(81673026)天津市科委应用基础与前沿计划重点资助项目(16JCZDJC34800)
论文发表日期:2018-01-01
在线出版日期:2026-08-14(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:8( 2564-2571 )
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