从TCMSP中药数据库中筛选猴痘病毒胸苷酸激酶抑制剂
王育伟1
田王琪1
张蔚桐1
汪一凡1
靳晓杰2
唐于平1
董泰玮1
1.陕西中医药大学药学院,西安 7120462.甘肃中医药大学药学院,兰州 730000
摘要:目的:运用虚拟筛选技术从中药数据库中筛选猴痘病毒胸苷酸激酶潜在的中药小分子抑制剂.方法:基于已公布的猴痘病毒胸苷酸激酶序列,利用同源模建技术构建猴痘病毒胸苷酸激酶三维结构,运用基于对接的虚拟筛选技术进行多轮筛选,包括高通量虚拟筛选、标准精度虚拟筛选、高精度虚拟筛选、Prime MMGBSA结合自由能筛选等.结果:筛选出了15 个对猴痘病毒胸苷酸激酶具有潜在抑制活性的化合物,并分析了化合物MOL002468,MOL009538,MOL000416,MOL009237 与胸苷酸激酶的结合模式,包括氢键、疏水相互作用、共轭和盐桥等受体-配体相互作用.结论:成功构建猴痘病毒胸苷酸激酶的虚拟筛选策略,发掘可用于预防、治疗猴痘病毒的药物,促进传统中药数据库的进一步开发和利用.
关键词:猴痘胸苷酸激酶分子对接结合自由能虚拟筛选
分类号:R965.1(药理学)
资助基金:国家自然科学基金(82003653)陕西省自然科学基金(2021JQ-734)
论文发表日期:2023-08-31
在线出版日期:2026-08-14(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:9( 1668-1676 )
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中国新药杂志

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CSTPCD北大核心CSCD
ISSN:1003-3734
年,卷(期):2023,32(16)
所属栏目:实验研究