基于HLA-B∗35∶01的何首乌致免疫特异质肝损伤易感成分预测
吴承钊1
高云娟1
牛明2
王伽伯3
母光頔4
赵旭4
肖小河1
1.成都中医药大学药学院,成都 611137;中国人民解放军总医院第五医学中心全军中医药研究所,北京 1000392.中国人民解放军总医院第五医学中心血液病医学部,北京 1000713.首都医科大学中医药学院,北京 1000694.中国人民解放军总医院第五医学中心全军中医药研究所,北京 100039;中国人民解放军总医院第五医学中心肝病医学部,北京 100039
摘要：目的:何首乌致肝损伤与HLA-B∗35∶01 等位基因密切相关,本研究借助机器学习和分子对接技术初步探索何首乌中潜在的HLA-B∗35∶01 易感成分.方法:通过检索文献和相关数据库,收集不良反应(ADR)与人类的主要组织相容性复合体(HLA)等位基因具有相关性的药物作为阳性数据集,未发现相关性的作为阴性数据集,利用PaDEL-Descriptor软件计算分子描述符,采用朴素贝叶斯(Naïve Bayes)构建二分类模型.利用模型预测何首乌中与HLA相关的ADR风险成分,并结合分子对接技术进一步分析其与HLA-B∗35∶01 蛋白晶体的结合能力以及结合模式.结果:使用Naïve Bayes算法构建的二分类模型平均准确率(ACC)为0.750,利用模型从何首乌41 种成分中识别出了28 种可能引起与HLA相关的ADR成分.分子对接结果显示何首乌中10 种成分与HLA-B∗35∶01 均具有较好的结合能力.多肽对接结果分析,反式二苯乙烯苷、大黄素-1-O-β-D-葡萄糖苷、大黄素甲醚-8-O-β-D-葡萄糖苷 3 种成分能够使非 HLA-B∗35∶01 呈递肽 P1(LPEPLPQGQLTAY)和P2(EECDSELEIKRY)的亲和性提高,并且与P1 和P2 间具有优势相互作用.结论:研究基于化学描述符构建分类预测模型,并结合分子对接技术预测何首乌中潜在的 3 种HLA-B∗35∶01 易感成分,辅助何首乌特异质肝损伤(IDILI)成分研究.
关键词：特异质型肝损伤人类白细胞抗原何首乌预测方法
分类号：R966(药理学)
资助基金：国家中医药管理局资助项目(ZYYCXTD-C-202005)国家自然科学基金(82230118)
论文发表日期：2024-02-29
在线出版日期：2026-08-14（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 351-359 )
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