药食同源物质定量结构-活性关系肝毒性预测与评估方法研究
章新友1
李莹2
吴地尧3
闵捷4
1.江西中医药大学智能医学与信息工程学院,南昌3 300002.江西中医药大学药学院,南昌 3300003.江西中医药大学中医学院,南昌3300044.南昌市人民医院,南昌 330000
摘要:目的:构建一个针对食药物质的定量结构-活性关系(quantitative structure-activity relationship,QSAR)肝毒性预测与评估方法,并将其用于白果、何首乌的肝毒性评价.方法:从SIDER数据库(SIDER 4.1,于2015 年10 月更新)和LiverTox(于2025 年3 月更新)中共收集1 110 种肝脏毒性不良反应的化合物作为阳性数据集,DILIrank(于2023 年9 月更新)中收集312 种不会造成肝损伤的化合物作为阴性数据集;运用Stone MIND Collector软件将搜集的化合物分子通过图片转换成分子结构的线性格式(Simplified Molecular Input Line Entry System,SMILES),然后Drug Flow平台的inno-QSAR构建肝毒性模型,采用5 倍交叉验证法对QSAR肝毒性模型进行准确性和稳健性验证.然后,于TCMSP数据库(Version 2.3,于2014 年5 月更新)和药智网数据库(于2024 年第4 季度更新)搜集并整合筛选得到72 种白果所含化合物和25 种何首乌所含化合物,采用上述QSAR肝毒性模型对2 种食药物质进行肝毒性预测和评价.结果:对构建的QSAR肝毒性模型拟合评价的结果是准确率(accuracy,ACC)为0.809;ROC曲线下面积AUC(receiver operating characteris-tic-area under curve,ROC-AUC)为0.757,F1 得分(F1)为 0.888,表示该模型准确度和精密度高,模型性能好,预测性高.预测结果显示白果和何首乌均属于"可能会引起肝毒性"的物质,白果引起肝毒性最有可能与化合物cardanol(C21 H34 O)、amentoflavone(C30 H18 O10)、ginkgolide B(C20 H24 O10)、ginkgolide J(C20 H24 O10)有关,何首乌引起的肝毒性最有可能与化合物pyrogallol(C6 H6 O3)、2,3,5,4'-tetrahydroxystilbene-2-O-β-D-gluco-side(C20 H22 O9)、citreorosein(C15 H10 O6)有关.结论:本文建立的食药物质QSAR肝毒性预测和评价方法,旨在更深入、精细地挖掘和评价食药物质的肝毒性,为早期识别和预警提供数据参考.
关键词:分子指纹定量结构-活性关系肝脏毒性食药物质药食同源
分类号:R932(生药学(天然药物学))
资助基金:江西省科技厅自然科学基金面上项目(20224BAB206115)江西省卫健委科技计划项目(202311134)江西省中医药管理局科技计划项目(2023A0398)南昌市医疗卫生引导性科技计划项目(2023YLWS034)江西省教育厅科技计划项目(GJJ190635)
论文发表日期:2026-01-15
在线出版日期:2026-08-14(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:11( 82-92 )
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中国新药杂志

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CSTPCD北大核心CSCD
ISSN:1003-3734
年,卷(期):2026,35(1)
所属栏目:实验研究