基于生物信息学途径探索与高原低氧心肌损伤相关微小RNA
施冰1
崔庆华2
冯振龙3
李俊峡1
1.中国人民解放军总医院第七医学中心, 北京,1007002.北京大学医学部生物信息学系, 北京,1008533.安徽医科大学研究生院, 合肥,230031
摘要：目的 通过高通量测序,筛选与高原低氧心肌损伤相关miRNA,为评估高原低氧心肌损伤提供新方法.方法 首先选取雄性6周龄SD大鼠置于实验舱模拟海拔7000 m环境下饲养,随机将大鼠分为低氧3 d、7 d、14 d和28 d组及常压常氧对照组,每组12只,记录大鼠呼吸频率及血氧饱和度.超声心动图评估大鼠心脏结构及功能.根据超声心动图和心肌组织病理,进一步选取高原低氧7 d组及对照组大鼠心肌组织,进行miRNA表达谱高通量测序,筛选差异表达miRNA.应用生物信息学方法,对差异表达miRNA进行GO功能和KEGG信号通路富集分析.选取5个显著差异表达miRNA,应用荧光定量PCR法,检测其在低压低氧暴露后不同时间点大鼠心肌和血浆表达变化.结果 成功构建大鼠高原低氧心肌损伤模型.与对照组比较,低氧暴露7 d大鼠左心室收缩和舒张功能显著下降(P＜0.05).心肌细胞出现肿胀、肌浆凝聚.高通量测序结果提示,与对照组比较,低氧暴露7 d大鼠心肌组织中18个miRNA表达发生显著变化.其中15个miRNA表达上调,3个miRNA表达下调.差异表达miRNA功能主要富集在氧化应激、细胞凋亡、自噬、细胞增殖、炎症等方面.PCR结果提示,随着低氧暴露时间延长,大鼠血浆中miR-144-3p表达水平显著升高.结论 高原低氧环境可造成大鼠心脏收缩和舒张功能受损.血浆miR-144-3p可能成为评估高原低压低氧心肌损伤的新的生物标志物.
关键词：高原低压低氧心肌损伤高通量测序微小RNA大鼠
分类号：R542.2(心脏、血管（循环系）疾病)
资助基金：全军后勤重点课题资助项目(BBJ14L001)
论文发表日期：2019-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 423-427 )
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