如何挖掘GEPIA数据库中研究数据并生成分析结果表达图
闫小妮1
田国祥2
潘振宇3
杨津3
柳青青3
吕军4
1.西安交通大学第一附属医院消化内科, 西安,7100612.解放军总医院第七医学中心, 北京,1007003.西安交通大学医学部公共卫生学院, 西安,7100614.710061 西安,西安交通大学医学部公共卫生学院;710061 西安,西安交通大学第一附属医院临床研究中心
摘要：GEPIA(Gene Expression Profiling Interactive Analysis)即基因表达谱数据动态分析,是一个由中国人新开发的用于癌症和正常基因表达谱分析的公共数据库,填补了癌症基因组学大数据信息的缺口.GEPIA分析来自TCGA和GTEx项目的9736个肿瘤和8587个正常样本的RNA测序表达数据,TCGA和GTEx的表达量数据都是在同一个pipeline下重新算出来的,可以直接进行非常全面的表达分析.该数据库是一个开放的公共数据库,感兴趣的研究者可以申请其中的数据进行相关研究,本文旨在对GEPIA数据库的架构以及基因数据的提取、分析、结果表达制图方法进行介绍.
关键词：基因表达谱GEPIA数据库数据分析结果表达
分类号：R4(临床医学)
资助基金：国家社会科学基金(16BGL183)
论文发表日期：2019-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 521-525 )
英文信息