SRA数据库架构及二代测序数据共享
李瑞华1
田国祥2
郭晓娟3
李豹4
张军4
吕军5
1.710061 西安,西安交通大学第一附属医院肿瘤外科;710061 西安,西安交通大学医学部公共卫生学院2.解放军总医院第七医学中心干四科, 北京,1007003.西安交通大学第一附属医院神经内科, 西安,7100614.西安交通大学医学部公共卫生学院, 西安,7100615.710061 西安,西安交通大学医学部公共卫生学院;710061 西安,西安交通大学第一附属医院临床研究中心
摘要:近年来,随着二代测序技术的迅猛发展,高通量测序数据也呈指数级增长,SRA (Sequence Read Archive)数据库是用于存储这些二代测序原始数据和比对信息的代表性数据库.SRA数据库建立至今,各项测序数据迅速累积,已囊括多个物种、多种应用,成为大规模二代测序数据库及高效率的测序数据存储、提取及共享的平台.该数据库目前持续更新并面向公众开放.本文将介绍SRA数据库的网站架构及测序原始数据提取方法.
关键词:SRA数据库二代测序数据提取
分类号:R4(临床医学)
资助基金:国家社会科学基金(16BGL183)
论文发表日期:2019-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:4( 1281-1284 )
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