循证研究与临床转化联合GEO数据库和网络药理学方法探讨芪参益气滴丸治疗心肌梗死的分子机制
季军峰1
赵桂峰2
1.300380 天津,天津中医药大学第一附属医院 国家中医针灸临床医学研究中心2.300380 天津,天津中医药大学第一附属医院心血管科
摘要:目的 使用GEO数据库和网络药理学方法探讨芪参益气滴丸(QSYQ)干预心肌梗死(MI)的疗效基础和作用机制.方法 GEO数据库筛选MI差异基因;TCMSP数据库以及文献检索筛选QSYQ的相关活性成分,SwissTargePrediction数据库预测成分的靶点;对差异基因和成分靶点取交集,Cytoscape软件构建"活性成分-交集靶点"调控网络;STRING数据库构建蛋白互作网络,Cytoscape中MCODE插件对网络进行分析,得到显著基因模块;clusterProfiler等R包对交集靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析;AutoDock Vina进行成分-靶点的分子对接.CIBERSORT算法对GEO数据进行免疫浸润分析,并对关键基因表达量和免疫细胞含量进行Spearman相关性分析.结果 共得到MI差异基因687个,活性成分靶点777个,交集靶点48个.PTGS2、MMP9、STAT3可能为QSYQ治疗MI的关键靶基因,分子对接模拟了与之对接最好的三个有效成分,分别为隐丹参酮、山奈酚、木犀草素.KEGG结果表明,交集靶点主要富集在NF-κB信号通路、TNF信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化等通路上.关键基因与活化的肥大细胞、中性粒细胞、活化的自然杀伤细胞具有显著正相关(P<0.05),与未活化的CD4记忆性T细胞呈显著负相关(P<0.05).结论 QSYQ治疗心肌梗死是以多成分、多靶点、多通路的方式进行的,研究初步确定了QSYQ疗效的物质基础、关键靶标和通路,以期为后续研究提供参考.
关键词:心肌梗死芪参益气滴丸分子对接免疫浸润网络药理学GEO芯片
分类号:R542.2(心脏、血管(循环系)疾病)
论文发表日期:2023-12-28
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:6( 1300-1304,1309 )
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