冠状动脉旁路移植术后心房颤动标志物的筛选与生物信息学分析
彭媛媛1
魏宝柱1
李行2
1.430071 武汉,武汉大学中南医院心血管内科2.430071 武汉,武汉大学中南医院综合医疗科
摘要：目的 通过生物信息学方法探究行冠状动脉旁路移植术(CABG)术后心房颤动(POAF)患者心脏组织的差异表达基因及相关信号通路分析.方法 通过GEO数据库获取GSE62871和GSE143924基因芯片数据集,将两个数据集合且去除批次效应,筛选CABG后发生POAF的患者为POAF组,未发生POAF的患者为non-POAF组,利用R语言的limma包获得差异表达基因(DEGs);分别采用DAVID、Webgestalt及STRING分析平台对DEGs进行基因本体(GO)分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析及蛋白质相互作用网络(PPI)分析;根据PPI网络的度值(Degree)筛选出枢纽基因,对枢纽基因行皮尔森(Pearson)相关性分析及受试者工作特征分析(ROC分析),明确枢纽基因之间的相关性及对POAF的诊断价值.结果 研究共获得符合条件的DEGs 151个,相较于non-POAF组,POAF组中表达上调的基因有130个,表达下调的基因有21个.GO分析表明DEGs主要参与了蛋白质水解、细胞黏附、转运等通路.KEGG信号通路富集分析主要涉及细胞黏附分子、紧密连接、补体与凝血级联通路等通路.PPI分析筛选获得了5个枢纽基因,分别为CDH1、C1QA、BMP2、EGR1和TLR2,对枢纽基因行相关性分析发现C1QA与TLR2之间存在强烈的正相关关系,进行ROC分析发现C1QA和BMP2诊断POAF的价值较高.结论 基于GEO数据库的生物信息学分析,CABG后发生/未发生POAF的患者间存在多个DEGs,且DEGs参与了多条生物学通路,这些DEGs可能是潜在的重要研究及治疗靶点.
关键词：冠状动脉旁路移植术术后心房颤动生物信息学靶点
分类号：R654.2(外科学各论)
资助基金：湖北省自然基金青年项目(2023AFB693)
论文发表日期：2024-02-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：4( 140-143 )
英文信息