基于孟德尔随机化和贝叶斯共定位分析的心肌病潜在靶基因筛选与验证
白玉
刘洁云
475000 开封,开封市中心医院心内科
摘要：目的 从基因层面筛选并鉴定与心肌病治疗相关的潜在靶点,为该类疾病的防控提供初步理论依据.方法 首先采用基于汇总数据的孟德尔随机化(SMR)方法,从eQTLGen数据库(基因组织来源为全血)中筛选出可能显著影响心肌病风险的潜在靶基因.其次,从GTEx数据库(基因组织来源为心肌组织)中提取同一批靶基因,并评估其对心肌病风险的遗传影响.再次,通过贝叶斯共定位分析验证这些靶基因与心肌病的遗传相关性,即它们是否共享因果变异位点.最后,利用SMR方法评估这些靶基因对3种特殊类型心肌病的风险影响,这3种类型包括疾病相关心肌病(如糖尿病心肌病等有明确诱因的心肌病)、药物性心肌病及酒精性心肌病.结果 在eQTLGen数据库的15 639个备选基因中筛选出10个潜在靶基因,这些基因在全血中的表达与心肌病风险显著相关.其中,NARFL、HAGHL、FAM173A、CCDC136、IGHMBP2、CCDC116及RNASEH2C七个基因在全血中的表达水平升高可显著增加心肌病的发病风险(P=2.67×10-4、2.08×10-5、2.14E×10-5、2.06×10-6、5.27×10-5、7.12×10-4、1.21×10-5);而SPATA24、SNX32及MRPL21这3个基因在全血中的表达水平升高则显著降低心肌病风险(P=1.46×10-4、5.56×10-4、5.58×10-5).在GTEx的心肌组织数据库中亦筛查出上述10个基因,并且这些基因在心肌组织中的表达对心肌病风险的影响与其在全血中表达时的作用一致(P＜0.05).贝叶斯共定位分析结果进一步支持上述SMR分析得出的结论,所有靶基因的共享因果变异后验概率均大于50%.然而,这10个靶基因对疾病相关心肌病、药物性心肌病及酒精性心肌病的风险影响均未达到显著性(P＞0.05).结论 NARFL、HAGHL、FAM173A、CCDC136、IGHMBP2、CCDC116、RNASEH2C、SPATA24、SNX32及MRPL21共10个在全血及心肌组织中表达的基因可能成为心肌病的重要治疗靶点.
关键词：心肌病治疗靶点孟德尔随机化贝叶斯共定位分析
分类号：R542.2(心脏、血管（循环系）疾病)
资助基金：河南省开封市科技发展计划项目(22HL010)
论文发表日期：2025-09-20
在线出版日期：2025-11-04（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 1055-1060 )
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