PCR-DGGE 技术应用于手足口病儿童口腔微生物菌群变化的初步研究
施春梅
周嫣
方邦骞
欧晓丽
谢庆玲
钟秀芬
1.广西壮族自治区人民医院口腔科, 南宁,5300212.广西壮族自治区人民医院口腔科, 南宁,5300213.广西壮族自治区人民医院口腔科, 南宁,5300214.广西壮族自治区人民医院口腔科, 南宁,5300215.广西壮族自治区人民医院口腔科, 南宁,5300216.广西壮族自治区人民医院口腔科, 南宁,530021
摘要:目的:应用PCR-DGGE技术对手足口病( HFMD)、疱疹性口腔炎( HGS)及正常儿童口腔微生物菌群变化进行初步分析,以期了解三者是否存在差异。方法按随机数字表法选择3例手足口病唾液样本,1例幼儿园正常儿童唾液以及1例疱疹性口腔炎患儿唾液。样本进行微生物群落总DNA的抽提;以此为模板扩增16S rRNA V3可变区,产物经DGGE指纹图谱分析其组成结构,并运用UVIBAND/MAP等软件比较所得群落指纹图谱的相似性指数;对DGGE指纹图谱上的泳带中优势条带切胶测序,进行基因序列分析,得出该样本的优势菌群。结果手足口病组优势菌群:Capnocytophaga嗜二氧化碳噬细胞菌、Selenomonas月形单胞菌属、Prevotella普氏菌属、TM7_genera_incertae_sedis菌属、Streptococcus链球菌属、Neisseria奈瑟菌属、Porphyromonas卟啉单胞菌属、Campylobacter弯曲菌属、Campylobacter弯曲菌属、Granulicatella菌属、Leptotrichia纤毛菌属、Veillonella 韦永氏球菌属、Bacteroides-like sp菌属、Actinomyces放线菌、Fusobacterium梭菌属。正常对照组优势菌群:Veillonella韦永氏球菌属、Capnocytophaga嗜二氧化碳噬细胞菌、 Prevotella普氏菌、Gemella双胎溶血菌属、Porphyromonas卟啉单胞菌属、Ruminococcaceae瘤胃球菌属、Lachnospiraceae毛螺菌属、Selenom-onas月形单胞菌属、Clostridium梭状芽孢杆菌、Haemophilus嗜血杆菌。疱疹性口腔炎组优势菌群:Lactococcus乳球菌属、Prevotella普氏菌属。结论手足口病组菌群结构更为复杂,与疱疹性口腔炎组相比菌群结构差异明显。
关键词:PCR-DGGE技术手足口病疱疹性口腔炎
分类号:R788(儿童口腔疾病)
资助基金:广西自然科学基金资助项目(编号2011GXNSFA018252)
论文发表日期:2015-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:5( 97-101 )
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