CLCA1在结直肠癌中的表达及其基因集富集分析
罗世波1
吴江妮1
丘新泽1
梁志海2
刘诗权1
1.530007 南宁,广西医科大学第二附属医院消化内科2.530021 南宁,广西医科大学第一附属医院消化内科
摘要:目的 探讨钙激活的氯离子通道辅助蛋白1(CLCA1)在结直肠癌(CRC)中的表达及其与临床病理特征和预后的关系,分析其基因集富集情况.方法 通过肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库下载CLCA1 mRNA表达数据,应用GSEA软件进行CLCA1不同表型的基因集富集分析.分析CLCA1 mRNA在CRC组织与癌旁组织中的差异表达,并分析其与临床病理特征的关联性.采用免疫组织化学染色法分析CLCA1在CRC组织和癌旁组织中的差异.结果 CRC组织中CLCA1表达较癌旁组织明显降低.CRC组织的免疫组织化学染色评分显著低于癌旁组织[(2.46±1.09)分vs(5.65±0.49)分;t=6.458,P=0.000].癌旁组织的CLCA1 mRNA表达水平显著高于临床Ⅰ~Ⅱ期CRC组织和临床Ⅲ~Ⅳ期CRC组织(P<0.05),临床Ⅰ~Ⅱ期CRC组织的CLCA1 mRNA表达水平显著高于临床Ⅲ~Ⅳ期CRC组织(P<0.05).CLCA1高表达组临床分期为Ⅰ~Ⅱ期、N分期为N0期以及M分期为M0期的人数比例显著大于CLCA1低表达组(P<0.05).CLCA1高表达组的生存预后显著优于CLCA1低表达组(χ2=8.200,P=0.004).基因集富集分析结果显示,有19个基因集显著富集于CLCA1高表达表型,未发现有基因集显著富集于CLCA1低表达表型.结论 CLCA1在CRC组织中表达下调,并且与患者的临床病理特征及预后有关,具有作为CRC诊断、治疗和预后预测标志物的潜力.
关键词:结直肠癌钙激活的氯离子通道辅助蛋白1诊断预后基因集
分类号:R735.3(消化系肿瘤)
资助基金:国家自然科学基金(81460380)广西自然科学基金(2017GXNSFAA198019)广西自然科学基金(2020GXNSFAA159056)
论文发表日期:2021-07-28
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:5( 675-679 )
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中国临床新医学

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ISSN:1674-3806
年,卷(期):2021,14(7)
所属栏目:论著