lncRNA HULC对肝癌细胞miRNA差异表达谱及ceRNA调控网络的影响
关璐璐1
韩松峰1
李世朋2
王梦姣1
邵晓亚1
乔兵兵3
席守民4
1.471000 洛阳,河南科技大学基础医学院医学科研中心2.454000 河南,焦作市人民医院普外二区3.450000 河南,郑州大学第一附属医院肝胆胰外科4.471000 洛阳,河南科技大学基础医学院医学科研中心;471000 洛阳,河南省血栓与止血国际联合实验室
摘要：目的 探究长链非编码RNA(lncRNA)肝癌高表达转录本(HULC)对肝癌细胞微小RNA(miRNA)差异表达谱及竞争内源性RNA(ceRNA)调控网络的影响.方法 选取人肝癌细胞系BEL-7402,瞬时转染HULC siRNA以降低lncRNA HULC的表达.通过高通量测序选取表达具有差异的miRNA,并通过实时荧光定量PCR进行验证.基于参考基因组,预测新miRNA.通过基因富集分析及ceRNA调控网络,研究这些基因的潜在功能.结果 经敲低lncRNA HULC表达后,通过高通量测序挑选出了9个表达差异显著的miRNA.5个miRNA表达下调,4个miRNA表达上调.通过miRDeep2打分,挑选出了15个分值较高的新miRNA.基因富集分析结果显示,表达下调的miRNA的靶基因的分子功能与丝氨酸tRNA连接酶活性、蛋白激酶活性、阳离子通道活性、钙转运ATP酶活性等有关;表达上调的miRNA的靶基因与硒代半胱氨酸裂解酶活性、过氧化物酶体机制靶向信号1结合、过氧化物酶体靶向序列结合、蛋白质N-末端结合、肿瘤坏死因子受体超家族结合等有关.miRNA-靶基因互作网络、显著富集功能-功能互作网络揭示靶基因与miRNA的关联性以及功能间的相关性.结论 在肝癌细胞系BEL-7402中lncRNA HULC具有调节多个表达差异的miRNA的作用,通过ceRNA调控网络模式,影响肝癌的发生、发展.
关键词：长链非编码RNA肝癌高表达转录本肝细胞癌高通量测序微小RNA
分类号：R735.7(消化系肿瘤)
资助基金：河南省重点研发与推广专项(科技攻关)项目(202102310126)河南省医学科技攻关计划联合共建项目(LHGJ20191342)
论文发表日期：2022-05-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 403-409 )
英文信息