基于TCGA数据库构建头颈部鳞癌RNA甲基化调控因子预后模型
彭颐1
宗丹1
葛宜枝1
何侠2
1.210009 江苏 南京,南京医科大学附属肿瘤医院/江苏省肿瘤医院/江苏省肿瘤防治研究所2.210009 江苏 南京,南京医科大学附属肿瘤医院/江苏省肿瘤医院/江苏省肿瘤防治研究所;210000 江苏 南京,211166 南京医科大学 第四临床医学院;221004 江苏 徐州,徐州医科大学
摘要：目的 探讨RNA甲基化调控因子与头颈部鳞癌(HNSCC)患者预后的相关性.方法 从TCGA数据库获取HNSCC样本与正常样本的基因表达谱及临床数据,评估43个RNA甲基化调控因子预测预后的价值.使用LASSO回归分析构建预后模型,将患者按风险评分划为高、低风险组,并对模型进行评估.根据高、低风险组差异表达的基因进行GO富集分析和ssGSEA分析.结果 HNSCC组织中显著差异表达的RNA甲基化调控因子共有38个.LASSO回归模型中,高风险组的5年生存率低于低风险组(P<0.001).单因素与多因素COX回归分析结果 显示该评分模型是HNSCC患者独立的预后因素(P<0.05).GO富集分析和ssGSEA分析提示高风险组的免疫功能可能受到抑制.结论 RNA甲基化调控因子在HNSCC的预后中发挥重要作用.
关键词：RNA甲基化调控因子头颈部鳞癌预后TCGA
资助基金：国家自然科学基金(81872192)江苏省科技厅重点研发计划(BE2019756)江苏省卫生健康委员会科研项目(K2019028)江苏省肿瘤医院科研基金项目(ZM202022)江苏省肿瘤医院博士后经费(SZL202013)
论文发表日期：2022-08-20
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 318-325 )
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