基于生物信息学分析UCHL3高表达水平作为食管癌预后标志物的潜在应用价值
刘萍丽
张丽
830054 新疆 乌鲁木齐,新疆医科大学第一附属医院 医学检验中心
摘要:目的 基于生物信息学方法探讨泛素羧基末端水解酶L3(UCHL3)高表达水平作为食管癌(EC)预后标志物的潜在应用价值.方法 基于公共数据库的原始数据,检测UCHL3 基因在EC中的表达情况.HPA检测UCHL3 的蛋白表达;Kruskal-Wallis test分析UCHL3 与EC临床分期和病理学分期的相关性;Kaplan-Meier 分析患者总生存期;LinkedOmics 分析 UCHL3 基因的富集情况;GSEA 分析UCHL3 的信号通路.结果 在泛癌分析中,与正常组织相比,33 种癌症中有 18 种癌症的UCHL3 mRNA表达水平升高(P<0.05).UCHL3 的高表达水平与EC的不良预后显著相关(P<0.05).免疫组化染色显示,与癌旁组织相比,UCHL3 蛋白在EC组织中表达上调(P<0.05).UCHL3 表达升高与癌症病理分期、临床分期和淋巴结转移显著相关(P<0.05).UCHL3 表达水平作为预测EC患者 1 年和 3 年预后的敏感度和特异性均较好.UCHL3 表达上调与EC患者预后不良相关.在病理分期Ⅰ~Ⅱ期和TNM分期T1~2N0~1M0 组中,与UCHL3 表达水平较低的EC患者相比,表达水平较高的EC患者总生存期明显较差.对UCHL3 的GO分析结果显示,UCHL3 参与的生物过程主要包括视觉发育、金属离子应答、信号释放和淋巴细胞分化等;UCHL3 的分子功能主要参与蛋白酪氨酸激酶活性、阴离子跨膜转运体活性等.在对UCHL3 的KEGG分子途径分析结果显示,显著相关的信号通路包括肝癌和甲状腺激素等.根据UCHL3 低表达组和高表达组之间的筛选差异表达基因,基因集富集途径分析结果显示,UCHL3 主要参与血管生成、IL-6-JAK-STAT3 信号通路、胆汁酸代谢、凝血信号通路、Notch信号通路、Hedgehog信号通路、活性氧自由基信号通路、过氧化物酶体信号通路等.结论 UCHL3 高表达水平作为EC预后标志物具有一定潜在的应用价值.
关键词:食管癌泛素羧基末端水解酶L3生物信息学预后标志物
资助基金:省部共建中亚高发病成因与预防国家重点实验室(SKL-HIDCA-2023-35)
论文发表日期:2025-06-20
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:8( 273-280 )
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