应用rDNA序列分型实现胶红酵母分子流行病学本地化调查
朱万骥1
唐朝贵2
林宁2
郭建3
崔兰英4
肖玉玲5
徐慧6
严岩7
鲁怀伟8
李宁9
冀旭峰10
徐英春11
黄晶晶2
1.南京医科大学附属淮安第一医院胃肠外科,淮安 2233002.南京医科大学附属淮安第一医院医学检验科,淮安 2233003.上海市东方医院南院检验科,上海 2001204.哈尔滨医科大学附属第一医院检验科,哈尔滨 1500815.四川大学华西医院检验科,成都 6100416.郑州大学第一附属医院检验科,郑州 4500527.北京大学第一医院检验科,北京 1000348.中国科学技术大学附属第一医院(安徽省立医院),合肥 2300019.福州大学附属省立医院检验科,福州 35000110.吉林大学第一医院检验科,长春 13000011.中国医学科学院北京协和医院检验科,北京 100730
摘要:目的 为满足监测单位实时调查胶红酵母分子流行病学,筛选高效、快速、经济的分子分型方法,以实现胶红酵母临床分离株的分子流行病学本地化监测.方法 收集中国医院侵袭性真菌病监测网(CHIF-NET)2010—2019年19所医院引发侵袭性感染的胶红酵母临床分离株73株,以及纳入21株环境分离株,基于DNA序列特征,筛选可本地化应用的胶红酵母分子流行病学监测方法.结果 结合rDNA上ITS序列和D1/D2序列共鉴定出12个rDNA序列型,59.6%(56/94)的菌株为rDNA序列2型,其中流行簇菌株占比92.9%(52/56);73个临床分离株共鉴定出49个微卫星型别,分辨力为0.986,流行簇菌株分属30个微卫星型别.结论 应用rDNA 序列分型可实现胶红酵母流行簇菌株的本地化甄别.当监测到rDNA序列2型胶红酵母临床株时,提示流行株在医院环境中持续存在.
关键词:胶红酵母分子流行病学本地化ITSD1/D2
分类号:R379.9(医学微生物学(病原细菌学、病原微生物学))
资助基金:南京医科大学附属淮安第一医院科技创新团队(YCT202302)
论文发表日期:2024-12-28
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:7( 541-547 )
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中国真菌学杂志

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ISSN:1673-3827
年,卷(期):2024,19(6)
所属栏目:论著