基于生物信息学分析干燥综合征伴发疲劳机制及中药预测研究
王梦洁1
刘英2
黄迪1
1.山东中医药大学,济南 2503002.山东中医药大学附属医院,济南 250000
摘要:目的 从生物信息学角度分析干燥综合征(sjogren's syndrome,SS)伴发疲劳相关的生物标记物,探讨SS伴发疲劳的发病机制,并通过差异基因预测治疗 SS 伴发疲劳的潜在中药.方法 从基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)下载GSE66795 数据集,使用R语言分析得到差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),对其进行基因本体(gene ontology,GO)及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析,后通过STRING数据库、Cytoscape软件及其插件得到关键基因,将关键基因与医学本体信息检索平台相互映射,筛选出治疗SS 伴发疲劳的中药.结果 共得到 48 个DEGs,包括 46 个上调基因和2 个下调基因,并筛选出10 个关键基因.GO和KEGG富集分析显示,这些基因多富集甲型流感、丙型肝炎、麻疹、冠状病毒-COVID-19 等多条病毒感染通路.筛选出 3 类潜在中药,分别为清肝、补肾、清热解毒类药物.结论 通过对DEGs的分析加深了对SS伴发疲劳发生机制的认识,并为中药治疗本病提供了潜在基因靶标及思路.
关键词:干燥综合征疲劳生物信息学差异表达基因中药预测
分类号:R259(中医内科学)R593.2(全身性疾病)
资助基金:山东省自然科学基金(ZR2023MH332)
论文发表日期:2024-01-28
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:6( 82-87 )
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中国中医基础医学杂志

中国中医基础医学杂志

ISSN:1006-3250
年,卷(期):2024,30(1)
所属栏目:临床基础