小鼠急性未分型流感嗜血杆菌中耳炎差异基因的互作网络特征分析
刘佳丽1
王维2
王子萌3
范芳梅3
马毓蓉3
余林1
何於娟3
1.重庆医科大学附属第一医院耳鼻咽喉科 重庆4000162.重庆医科大学检验医学院,临床检验诊断学教育部重点实验室 重庆400016;重庆市第六人民医院 重庆4000803.重庆医科大学检验医学院,临床检验诊断学教育部重点实验室 重庆,400016
摘要：目的利用基因表达数据库(GEO)查找小鼠中耳炎表达谱基因芯片原始数据,建立中耳炎基因互作网络图.方法从公共数据库GEO中下载小鼠中耳炎相关数据集,采用Affymetrix Expression Console软件和Tran?scriptome Analysis Console(TAC)软件筛选差异表达基因,将差异基因导入STRING在线数据库进行分析,绘制差异基因互作网络图,并将互作网络数据导入Cytoscape 3.4.0软件中,筛选网络中心节点,并取其中相对独立、作用较为集中且与炎症基因相关子网络,采用David在线工具对其进行功能注释富集分析.结果共筛选出1166个差异表达基因,其中表达上调793个,表达下调373个,经STRING在线工具筛选后共有459个小鼠中耳炎差异基因编码的蛋白存在相互作用,并得到相应蛋白互作网络,分析其中与炎症相关子网络.结论本研究利用生物信息学技术构建了中耳炎差异基因互作网络,其中的网络中心节点基因,对于中耳炎分子机制研究及靶向治疗具有指导作用.
关键词：未分型流感嗜血杆菌中耳炎基因芯片互作网络
分类号：R764.21(耳科学、耳疾病)
论文发表日期：2017-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 94-98 )
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