巨细胞病毒感染耳蜗上皮细胞差异表达的miRNA筛选及验证
李俎怡1
何蓉2
1.中国医科大学附属盛京医院临床遗传科,沈阳110001;珠海市妇幼保健院检验科(遗传研究所),珠海5190002.中国医科大学附属盛京医院临床遗传科,沈阳110001
摘要:目的 分析巨细胞病毒感染与未感染小鼠耳蜗上皮细胞差异表达的miRNA,以探索miRNA在巨细胞病毒感染过程中的作用及其调控机制.方法 通过构建小鼠巨细胞病毒感染的小鼠耳蜗上皮细胞模型,用高通量检测技术进行全转录组测序,检测巨细胞病毒感染72小时后耳蜗上皮细胞中miRNA的表达情况,利用生物信息学技术分析差异表达的miRNA的基本特点,筛选出差异表达明显的miRNA并进行验证.结果 共检测到差异表达的miRNA143个,其中已知的有81个,新发现的miRNA有62个.挑选16个差异表达的miRNA进行实时荧光定量PCR验证,其中有10个(mmu-miR-702-5p,mmu-miR-135b-5p,mmu-miR-449c-5p,mmu-miR-7b-5p,mmu-miR-7a-5p,gga-miR-1709,oan-miR-1417-5p,rno-miR-679,aca-miR-5446表达上调,mmu-miR-26a-5p表达下调)miRNA的变化趋势与测序结果趋势一致.结论 本文研究结果揭示了巨细胞病毒感染小鼠耳蜗上皮细胞miRNA的表达变化,这些差异表达的miRNA可能在巨细胞病毒致聋的过程中发挥着一定作用,为从转录层面及非编码RNA角度进一步研究巨细胞病毒的致聋机制找到了新方向.
关键词:巨细胞病毒耳聋miRNA高通量测序
分类号:R764(耳科学、耳疾病)
资助基金:辽宁省自然科技基金(2015020537)
论文发表日期:2021-02-28
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:7( 83-89 )
英文信息
