不同乙醇预处理方式对LMD分离牙胚组织总RNA完整度的影响
党平1
聂敏媛1
董亮2
崔三哲1
汤楚华1
史亮1
郑翰圣3
董蕊4
施生根5
1.解放军第306医院口腔科 北京 1001012.天津大港油田总医院口腔科 天津3002803.韩国廷世大学口腔医学院解剖发育学教研室 首尔 1207524.首都医科大学口腔医学院口腔医学研究所 北京 1000505.解放军第306医院口腔科 北京100101
摘要：目的:探求不同乙醇预处理方式是否对激光显微切割(Laser microdissection,LMD)技术分离获得的小鼠牙胚组织总RNA完整度有影响.以提高LMD技术获取样品的完整度,使之满足后续基因芯片等高通量实验对样品的质检要求.方法:本实验按照LMD切割前是否乙醇预处理的方式分为无预处理LMD组、梯度乙醇处理组以及100％乙醇处理组三组.以LMD技术获取胚胎17天(Embryonic 17,E17)和出生后2天(Postnatal 2,PN2)两时期CD1小鼠下颌第一磨牙的牙胚组织；提取各组总RNA,再以核糖体RNA 28s/18s比值、RNA完整度数值(RNA Integrity Number,RIN),以及样品电泳图的图形来综合判断样品完整度.数据进行统计分析.结果:100％乙醇处理组,RIN值最高且与另两组相比差异有显著性,梯度乙醇处理组RIN值与无预处理LMD组相比,并无显著性差异；以28s/18s比值为指标,100％乙醇预处理组高于其它两组,但差异并无显著性;梯度乙醇处理组与无预处理LMD组间差异亦无统计学意义.结论:100％乙醇直接处理方式更适合用于LMD切割样品的防降解预处理,可显著减少切割过程中的组织RNA完整度破坏.该步操作将有利于获得符合高通量实验质检标准的芯片实验样本.
关键词：激光显微切割技术牙胚发育间充质RNA完整度
分类号：R783(口腔矫形学、牙科美学)
资助基金：全军重点项目(十一五)(06MA004)
论文发表日期：2012-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 265-268,303 )
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