基于生物信息学探索代谢综合征与种植体周炎潜在共同生物标志物及相关免疫细胞浸润的关系
陈宇翔
赵安娜
杨霞
杨浩然
程婷婷
饶先琦
李自良
650000,昆明医科大学附属口腔医院云南省口腔医学重点实验室
摘要：目的 本研究旨在揭示代谢综合征(metabolic syndrome,MetS)与种植体周炎(peri-implantitis,PI)之间潜在共同生物标志物及相关免疫细胞浸润,并构建PI诊断模型.方法 从GEO数据库下载MetS与PI的转录组数据,利用加权基因共表达网络分析和差异表达分析筛选出两疾病的共同致病基因,对其类别进行界定并进行富集分析.利用LASSO和Boruta算法筛选枢纽基因后构建PI诊断模型.利用Pearson相关性分析枢纽基因与牙周和种植体周探诊深度的相关性.利用CIBERSORT软件对MetS和PI样本进行免疫浸润分析,并探讨枢纽基因与免疫细胞浸润的关系.结果 共筛选出81个共同致病基因,其中糖尿病和骨质疏松症相关基因占比较高,主要富集在与趋化因子及其受体相关的信号通路中.最终确定2个枢纽基因(BATF和CD79B)并构建了诊断模型(AUC=0.932).免疫浸润分析显示两疾病疾病组和健康组间的免疫细胞浸润水平存在明显差别,且枢纽基因与不同免疫细胞群体之间存在显著相关性.结论 BATF和CD79B是MetS和PI的潜在共同生物标志物且与宿主免疫过程间存在密切联系,基于此构建的诊断模型可为MetS患者在PI的预防和早期诊断上提供帮助.
关键词：种植体周炎代谢综合征机器学习生物信息学免疫浸润分析
分类号：R78(口腔科学)
资助基金：国家自然科学基金(82360185)昆明医科大学教学研究教学改革项目(2024-JY-Z-19)
论文发表日期：2025-01-20
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：10( 37-46 )
英文信息