Nε羧甲基赖氨酸靶向清道夫受体CD36的分子对接研究
王中群1
包正阳2
孙振2
严金川2
邵晨2
李丽华3
1.江苏省原子医学研究所,214063 无锡2.江苏大学附属医院心内科3.江苏大学附属医院病理科
摘要：目的 观察Nε羧甲基赖氨酸(Nεcarboxymethyl lysine,CML)是否与清道夫受体CD36具有良好的分子对接,形成稳定的相互作用.方法 使用免疫共沉淀技术研究CML和CD36相互作用,采用AutoDock 4.2、iBabel及XQuartz-2.7.7软件计算CD36与CML的结合模式和亲和力.结果 免疫共沉淀显示,抗CD36抗体磁珠能够沉淀出RAW264.7细胞总蛋白中的CD36,通过抗CML抗体能检测出与CD36结合的CML.选择小分子化合物CML与最优的CD36胞外段4Q4B蛋白结构进行对接分析显示,化合物CML与CD36胞外段4Q4B蛋白结构的亲和力为-29.62kJ/mol.CML可占据4Q4B结合口袋开口的1/2左右,ARG82、ASN71和THR70为受体互作氨基酸.进一步的对接分析显示,CML可以与4Q4B形成3个相互作用的氢键,对接预测抑制常数6.92,均方根偏差2.54.结论CML与CD36胞外段4Q4B蛋白结构具有较好的对接,可形成稳定的相互作用,氢键是主要的相互作用方式.
关键词：受体清道夫抗原CD36泡沫细胞糖尿病
资助基金：国家自然科学基金(81370408)国家自然科学基金(81770450)实验室开放基金(KF201504)
论文发表日期：2019-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：3( 519-521 )
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