中国人前列腺癌发病关键基因的生物信息学研究
王刚1
杨阔1
孟帅2
徐勇1
杨志华3
刘妍1
1.天津医科大学第二医院泌尿外科/天津市泌尿外科研究所,天津,3002112.北京协和医学院医药生物技术研究所,北京,1000503.天津医科大学生物医学工程系,天津,300070
摘要：目的:利用国内相关研究中已筛选出的前列腺癌差异表达基因,构建基因相互作用网络,通过统计学分析,进一步筛选对该网络具有重大影响的基因,探寻对前列腺癌发生起关键作用的基因,进而阐述中国人前列腺癌发病的分子机制.方法:查找近年来国内发表的相关文献,利用其筛选出的有关中国人前列腺癌基因表达谱数据,归纳出前列腺癌差异表达基因;运用NCBI中OMIM数据库分析其功能,总结出基因之间的相互关系,构建基因相互关系网络模型;运用统计学方法(节点收缩法)比较关键基因的重要度.结果:综合国内发表的有关论文中的基因表达谱数据,得到差异表达基因113条,其中上调基因51条,下调基因62条;运用OMIM数据库构建出一个包含68条基因的具有相互关系的基因网络模型;用节点收缩法统计出各个基因的重要度,从而找出了网络中起关键作用的基因,包括c-MYC、VEGF、HSPCA、TGFβ1、RANTES、EGR1等共12条基因,这些基因很可能在前列腺癌的发生发展中起着重要作用.结论:本研究运用生物信息学方法对国内前列腺癌基因芯片结果进行分析和研究,将含有基因信息的OMIM数据库和评价网络节点重要性的节点收缩法结合,对一批前列腺癌差异表达基因建立了相互作用网络,并对网络中的关键基因进行评估,从而构建了一个在整体水平上对基因表达谱数据进行分析的网络模型,为后续工作中对前列腺癌发病机制的研究提供了新的途径.
关键词：前列腺癌基因表达谱OMIM数据库基因网络节点收缩
分类号：R697+.3(泌尿科学（泌尿生殖系疾病）)
资助基金：天津市科技计划(07ZCGYSF01000)
论文发表日期：2010-04-02
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
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