基于基因芯片的前列腺癌转移高表达基因SPP1的生物信息学分析
李铁求1
滕伊漓1
邹亚光2
杨宇3
李琦3
毛向明3
1.湖南省马王堆医院泌尿外科,湖南长沙4100162.南方医科大学附属南方医院口腔科,广东广州5105153.南方医科大学附属南方医院泌尿外科,广东广州510515
摘要：目的:利用生物信息学方法分析前列腺癌转移高表达基因SPP1以及蛋白的结构,为进一步研究其功能和参与的调控机制提供一定的理论依据. 方法:在公共基因芯片数据库(GEO)中下载前列腺癌转移相关基因芯片数据,利用BRB-ArrayTools软件、protparam、Motif Scan、SignalP4.0、TMHMM、NetPhos2.0、PredictProtein、GO、KEGG、STRING等生物信息学工具进行数据挖掘及生物信息学分析. 结果:共筛选出前列腺癌转移共同差异基因73个,表达上调21个,表达下调52个(P＜0.01),其中对前列腺癌转移高表达基因SPP1进行生物信息学分析发现,SPP1蛋白由314个氨基酸组成,该蛋白含有2个N-连接糖基化位点、8个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、3个PKC磷酸化位点,主要参与细胞外基质结合、骨化、成骨细胞分化、细胞黏附、PI3 K-Akt信号通路、黏着斑、ECM受体相互作用、Toll样受体信号通路等分子功能和信号通路. 结论:利用生物信息学的方法能有效分析基因芯片数据并获取生物内在信息,SPP1可能在前列腺癌转移中发挥重要作用,有望成为前列腺癌转移的早期诊断标志物和治疗的新靶点.
关键词：SPP1基因生物信息学前列腺癌转移相关基因基因芯片
分类号：R737.25(泌尿生殖器肿瘤)
论文发表日期：2014-10-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
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