长链非编码RNA在不同受孕能力精子中差异表达的初步分析
赵文忠1
罗招凡2
邓顺美1
马春杰1
秦卫兵1
1.广东省计划生育科学技术研究所国家卫生和计划生育委员会男性生殖与遗传重点实验室,广东广州5106002.中山大学附属第七医院检验科,广东深圳518017
摘要：目的:通过对两组不同受孕能力的精子差异长链非编码RNA (lncRNA)的分析,寻找与受孕能力相关的lncRNA,探讨其在受精过程中可能的作用. 方法:各取5份高、低受孕力的精液标本,提取大RNA,建cDNA库并测序.应用生物信息学方法,组装并预测lncRNA.采取NOIseq方法筛选两组间有差异表达的lncRNA,绘制箱图和火山图;运用Cluster软件进行表达模式聚类分析.采用基因本体(GO)及Pathway分析差异表达的lncRNA功能分布,利用lncRNA-mRNA互作分析和上下游顺式作用元件的交集分析,来预测lncRNA的功能. 结果:预测到471 615个lncRNA,其中新lncRNA 463 596个,已知lncRNA 8 019个.差异表达分析结果显示,有4 052个lncRNA存在显著差异,其中上调的985个,下调的3 067个.箱图和火山图显示出两组间存在明显的差异,表达模式聚类分析显示出两组间存在明显的差异.GO功能分类注释得出,差异表达的lncRNA主要参与新陈代谢、生物调节、细胞膜及细胞器形成、蛋白核酸结合等;Pathway分析显示,差异表达的lncRNA主要与运输分解代谢、细胞运动、信号分子相互作用、信号转导、以及发育和免疫系统信号通路等有关.5个lncRNA的预测功能表明,它们可能与受精过程中的精子运动、顶体反应、信号转导相关. 结论:差异表达的lncRNA可能在受精过程中有重要作用,可能成为评估精子质量的生物标志物.
关键词：长链非编码RNA精子受孕能力
分类号：R698+.2(泌尿科学（泌尿生殖系疾病）)
资助基金：广东省自然科学基金(2016A030313813)广州市科技计划(201607010137)广东省医学科研基金(A2018285)
论文发表日期：2019-01-20
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 16-21 )
英文信息