睾丸癌基因表达谱的生物信息学分析
蒋平1
夏伦斌2
钟枝梅2
娄新建2
方妍2
左瑞华1
1.皖西学院生物制药工程学院,安徽六安237012;安徽省中药资源保护与持续利用工程实验室,安徽六安2370122.皖西学院生物制药工程学院,安徽六安237012
摘要：目的:分析与睾丸癌生存相关的差异基因,探索其发病机制.方法:从GEO数据库中获取睾丸癌基因表达数据集GSE8607,并使用GEO2R在线工具分析获得睾丸癌差异性表达的基因;使用DAVID网站进行GO和KEGG pathway富集,使用STRING和Cytoscape软件进行睾丸癌相关核心基因筛选,使用Kaplan Meier plotter和GEPIA网站分别对睾丸癌相关核心基因进行生存率和表达量分析.结果:共筛选出591个差异表达基因,其中上调基因216个,主要富集23个生物学过程,8个细胞组成,5个生物功能,7条KEGG pathway通路;下调基因375个,只富集到生物学过程,涉及精子的形成与发育等过程.编码蛋白相互作用网络分析获得32个核心基因,其中C1QB、CCL2、CCR2、GPR183、SELL、LAPTM5、NPY5R、CD28、MMP9等9个基因与生存率密切相关(P＜0.05),C1 QB、CCL2、CCR2、SELL、LAPTM5、CD28、MMP9等7个基因在睾丸癌组织中高表达(P＜0.05),NPY5R在睾丸癌组织中低表达(P＜0.05).结论:发现的8个在睾丸癌组织中差异性表达的基因,可以有效的预测患者的生存率,对癌症的诊断、预防、治疗及抗癌新药的开发具有一定的参考意义.
关键词：睾丸癌基因差异表达生物信息学生存率
分类号：R737.2(泌尿生殖器肿瘤)R73-31(肿瘤学实验研究)
资助基金：现代农业产业技术体系(CARS-21)皖西学院自然科学重点项目(WXZR201932)科技创新项目(202007d07050003)贫困县专项(201904f06020008)本科质量工程项目(2016sjjd079)本科质量工程项目(2018zygc075)本科质量工程项目(2018jyxm1153)皖西学院教学研究项目(wxxy2018026)皖西学院创新创业人才培养模式改革试验区项目(wxxy2017116)
论文发表日期：2021-03-20
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 195-200 )
英文信息