基于TCGA数据库和炎症相关基因构建前列腺癌预后模型
钟荣芳
吴俊超
凌佳城
孟佳林
樊松
安徽医科大学第一附属医院泌尿外科/安徽医科大学泌尿外科研究所/泌尿生殖系统疾病安徽省重点实验室,安徽合肥230022
摘要：目的:探讨炎症相关基因对前列腺癌(PCa)患者预后的影响.方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载PCa患者的临床资料和mRNA测序数据,分子特征数据库(MSigDB)下载炎症相关通路基因.通过单因素回归和LASSO回归分析筛选炎症基因构建预后风险模型,多因素回归分析筛选PCa独立预后因素构建列线图.根据列线图计算患者的风险评分,并以中位值分为高、低风险评分两组,识别差异表达基因进行富集分析.最后通过免疫组化染色验证PCa组织芯片中SPHK1的表达水平.结果:从172个候选基因筛选19个炎症相关基因构建预后风险模型,其中 CD14、PIK3R5、GABBR1、RELA、IRF7、SCARF1、MSR1、SPHK1、OSM 和 STAB1 是风险基因,AQP9、LPAR1、ATP2C1、NDP、CXCL6、P2RY2、DCBLD2、PCDH7 和 IFNAR1 是保护基因.Kaplan-Meier 分析显示高炎症评分组患者无复发生存期明显低于低炎症评分组患者,高风险评分患者的预后较低风险评分差.差异表达基因主要参与炎症通路的激活.免疫组化结果提示SPHK1在肿瘤组织中的表达高于正常组织,且随Gleason评分的增加而增加,SPHK1表达与包膜侵犯存在相关性.结论:基于TCGA数据库构建的炎症相关基因预后风险模型能够有效预测PCa患者的预后.
关键词：前列腺癌TCGA数据库炎症相关基因预后风险模型
分类号：R737.25(泌尿生殖器肿瘤)
资助基金：安徽省重点研究与开发计划项目(2022e07020037)安徽省自然科学基金(2208085MH208)重大科技成果工程化项目(2021YL003)安徽医科大学校科研基金项目(2020xkj171)
论文发表日期：2022-11-20
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：11( 985-995 )
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