基底膜相关基因模型预测前列腺癌患者生化复发
王祖恒1
刘喆2
赵晓东1
胡恩艳3
陈宇豪2
徐晓峰2
夏菁2
刘有黄2
董杰2
许松4
程文4
1.南京医科大学金陵临床医学院,江苏 南京 2100022.南京大学医学院附属金陵医院/东部战区总医院泌尿外科,江苏 南京 2100023.南京大学医学院附属金陵医院/东部战区总医院麻醉科,江苏 南京 2100024.南京医科大学金陵临床医学院,江苏 南京 210002;南京大学医学院附属金陵医院/东部战区总医院泌尿外科,江苏 南京 210002
摘要：目的:构建和验证前列腺癌(PCa)基底膜的关键基因模型,以预测PCa进展和根治性前列腺切除术后生化复发.方法:根据肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中有关PCa的相关转录组数据、基因突变数据和临床数据,分析正常前列腺组织及PCa组织间基底膜相关基因中的差异表达基因(DEG),并进行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析.筛选DEG中预后相关基因,分析其突变情况.根据根治性前列腺切除术后随访情况和生化复发,构建预后风险评分模型.使用基因表达综合(GEO)数据库验证模型的准确性,对模型进行生存分析、主成分分析(PCA)、独立预后分析并构建接受者操作特征(ROC)曲线.免疫组化结果验证模型正确性,构建蛋白互作网络.构建列线图、ROC曲线和校准曲线验证列线图的准确性.结果:共筛选出 85 个DEG,其中上调基因 18 个,下调基因67 个.以其中 11 个基因构建模型,高危组患者发生生化复发的风险高于低危组(HR:3.51,95％CI:2.32～5.32,P＜0.001).使用 GEO 数据库数据验证发现,高危组患者发生生化复发的风险显著高于低危组(P＜0.001).此外,高危组患者的年龄更大、临床T分期更高、Gleason评分更高、淋巴结阳性率及阳性淋巴结数目更高、残留肿瘤比例更高(P均＜0.05).使用患者年龄、pN分期、pT分期、cT分期、Gleason评分及预后风险评分构建了列线图,其ROC曲线下面积高于其他预测指标,校准图显示预测结果和实际结果的一致性.结论:本研究建立了基底膜相关基因预后风险评分模型,并构建了有效的列线图,可预测接受根治性前列腺切除术的PCa患者生化复发的风险.
关键词：前列腺癌生化复发基底膜细胞外基质
分类号：R737.25(泌尿生殖器肿瘤)
论文发表日期：2022-12-20
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 1071-1079 )
英文信息