基于网络药理学与分子对接技术探讨聚精丸治疗精索静脉曲张性男性不育的作用机制
廖开森1
王恒2
姜永生2
陈建淮2
张星2
孙志兴2
陈赟2
1.南京中医药大学附属医院/江苏省中医院男科,江苏 南京210029;浙江省立同德医院泌尿外科,浙江 杭州3100122.南京中医药大学附属医院/江苏省中医院男科,江苏 南京210029
摘要:目的:基于网络药理学与分子对接技术探讨聚精丸治疗精索静脉曲张性男性不育的潜在作用机制.方法:通过TCMSP数据库及BATMAN数据库检索聚精丸中药成分并获取成分对应的靶点;在"GeneCards""DIS-GENET""OMIM""HPO"数据库检索"varicocele"、"male infertility",获得精索静脉曲张性男性不育的潜在靶点;利用jvenn工具绘制韦恩图,获得中药靶点与疾病靶点的交集靶点;筛选出与交集靶点相对应的成分及中药,在Cyto-scape3.8.2构建中药-活性成分-靶点网络图;应用STRING平台构建病药交集靶点的蛋白-蛋白相互作用网络(PPI);将病药交集靶点导入DAVID数据库进行GO富集分析并进行基于KEGG的通路富集分析;再将病药交集靶点上传至KEGG数据库,选择与本课题最为相关的通路,使用mapper工具构建KEGG通路图;进一步使用FDR值排名前15的通路与其相关靶点、成分绘制核心成分-靶点-通路图;最后,利用AutoDock及PyMol软件对核心基因的蛋白受体和小分子配体进行分子对接验证及结果的可视化分析.结果:共筛选出聚精丸207种成分和1103个预测靶点;精索静脉曲张性男性不育疾病靶点285个;韦恩图获得共同靶点86个;GO结果分析显示生物过程(BP)显著富集于基因表达的正向调控、转录正调控、凋亡过程的正、负调控、缺氧反应、对雌二醇的反应、一氧化氮生物合成过程的正调控等;细胞组分(CC)显著富集于大分子、细胞质、核、磷脂酰肌醇3-激酶复合物等;分子功能(MF)显著富集于酶绑定、相同蛋白结合、转录共激活因子结合等;KE GG分析结果显示通路富集于癌症通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、HIF-1信号通路、FoxO信号通路等;分子对接结果显示核心成分与关键靶点有较好的结合能.结论:聚精丸的有效活性成分通过多靶点、多通路治疗精索静脉曲张性男性不育,为进一步的细胞实验及动物实验奠定了理论基础.
关键词:网络药理学聚精丸精索静脉曲张男性不育分子对接作用机制
分类号:R698+.2(泌尿科学(泌尿生殖系疾病))
论文发表日期:2023-08-20
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:10( 688-697 )
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中华男科学杂志

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ISSN:1009-3591
年,卷(期):2023,29(8)
所属栏目:临床研究