基于TCGA和GTEx数据库分析GDF3在睾丸癌中的表达及意义
闫泽晨1
刘统虎2
于栓宝2
詹永豪2
王智宇2
朱照伟2
任翼麟2
商学军3
张雪培2
1.郑州大学第一附属医院泌尿外科,河南 郑州450001;南方医科大学南京临床医学院/东部战区总医院泌尿外科,江苏 南京2100022.郑州大学第一附属医院泌尿外科,河南 郑州4500013.南方医科大学南京临床医学院/东部战区总医院泌尿外科,江苏 南京210002
摘要:目的:通过生物信息学研究GDF3在睾丸癌中的表达及意义.方法:联合TCGA及GTEx数据库,通过差异分析和泛癌分析确定目标基因GDF3,通过UALCAN数据库分析睾丸癌中GDF3的临床相关性.基于R语言程序包"org.Hs.eg.db","clusterProfiler",通过基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析研究GDF3在睾丸癌中潜在的功能.通过TISIDB数据库研究睾丸癌中GDF3与免疫趋化因子、免疫抑制剂的相关性.结果:GDF3在睾丸癌中显著高表达(P<0.001),且与临床分级(P<0.05)、肿瘤分型(P<0.001)密切相关.免疫相关性分析结果显示,GDF3与免疫趋化因子CCL26(rho=0.599,P<0.001)、CCL7(rho=0.525,P<0.001)、免疫抑制剂ADORA2A(rho=0.723,P<0.001)、PVRL2(rho=0.585,P<0.001)密切相关.结论:GDF3与睾丸癌的发生发展以及免疫微环境密切相关.
关键词:睾丸癌GDF3生物信息学免疫微环境
分类号:R737.21(泌尿生殖器肿瘤)
论文发表日期:2023-12-20
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:6( 980-985 )
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