基于单细胞转录组联合孟德尔随机化探讨固醇载体蛋白2基因与前列腺癌的关系
宁家昕1
罗书航1
王浩然1
侯惠民2
刘明2
1.北京医院/国家老年医学中心/北京协和医学院/中国医学科学院泌尿外科,北京 1000052.北京医院/国家老年医学中心/北京协和医学院/中国医学科学院泌尿外科,北京 100005;北京医院/国家老年医学中心/老年医学研究所/中国医学科学院泌尿外科,北京 100005
摘要：目的:利用单细胞转录组和孟德尔随机化,从多组学角度研究脂质代谢相关基因固醇载体蛋白2(SCP2)与前列腺癌(PCa)之间的关系.方法:从GSE120716、GSE157703和GSE141445数据集分别获得良恶性前列腺组织的单细胞转录组数据,对数据进行整合、质控和注释后将上皮细胞分为高SCP2表达组和低SCP2表达组,然后进一步进行差异分析和轨迹分析.随后从基因型-组织表达(GTEx)下载SCP2表达数量性状位点(eQTL)的单核苷酸多态性(SNP)数据,并从PCa协会调查癌症相关基因组改变小组(PRACTICAL)获得PCa结局数据进行孟德尔随机化分析,验证SCP2与PCa的因果关系.结果:高SCP2表达上皮细胞具有更旺盛的能量代谢以及增殖能力的同时具有低免疫治疗应答以及转移倾向.轨迹分析结果显示高SCP2表达的上皮细胞可能具有更高的恶性程度,同时SCP2可能是前列腺恶性上皮细胞分化的关键标志基因.进一步的孟德尔随机化结果显示,SCP2和PCa的发生发展具有显著的因果关系(OR=1.045,95％CI:1.010～1.083,P=0.011).结论:通过联合单细胞转录组和孟德尔随机化,证实了 SCP2基因在PCa发生发展中的作用,并为PCa治疗提供了新的靶点和治疗方向.
关键词：单细胞转录组测序孟德尔随机化前列腺癌脂质代谢固醇载体蛋白2基因
分类号：R737.25(泌尿生殖器肿瘤)
论文发表日期：2025-05-20
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 403-411 )
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