胶质母细胞瘤基因表达谱及相关基因的聚类研究
陈菊祥1
卢亦成1
胡国汉1
骆纯1
楼美清1
应康2
李瑶2
谢毅2
1.第二军医大学附属长征医院神经外科,上海市神经外科研究所,上海,2000032.复旦大学生命科学学院遗传学研究所,上海,200433
摘要：目的探讨人脑胶质母细胞瘤发生、发展中相关基因的表达及功能.方法用含13 939种人类基因的BioStarH140S型表达谱芯片,以正常成人脑及不同级别胶质瘤组织总RNA制备的探针杂交芯片;ScanArray 4000扫描芯片荧光信号,提取脑及胶质瘤组织差异基因并进行生物信息分析;用Hierarchical聚类对胶质瘤差异基因进行特征提取;用Northern杂交验证及进行初步功能研究.结果正常脑与18例不同级别胶质瘤组织间筛选出多类差异表达基因,通过生物信息学和Hierarchical聚类,发现α-连环素、微型染色体维护蛋白7、细胞周期素B2、FBX05、着丝粒蛋白F基因与胶质母细胞瘤密切相关,该类基因在低级别胶质瘤中表达差异不明显,但胶质母细胞瘤中表达明显上调.Northern杂交显示该类基因与胶质母细胞瘤密切相关,与芯片结果一致.结论基因表达谱芯片可快速、高效地筛选胶质瘤相关基因,发现的5条基因与胶质母细胞瘤侵袭性强密切相关,可成为判断胶质瘤预后的分子生物学指标.
关键词：脑胶质母细胞瘤基因芯片表达谱Hierarchical聚类
分类号：R739.4(神经系肿瘤)
资助基金：上海市科委项目(034119835)国家自然科学基金(30100192)
论文发表日期：2004-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：4( 222-225 )
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