应用iTRAQ技术筛选DNT差异表达蛋白
廖秋林
张伟
彭大云
王蔚
张海燕
陈晓东
1.广州军区广州总医院病理科,广东广州,5100102.广州军区广州总医院病理科,广东广州,5100103.广州军区广州总医院病理科,广东广州,5100104.广州军区广州总医院病理科,广东广州,5100105.广州军区广州总医院病理科,广东广州,5100106.广州军区广州总医院病理科,广东广州,510010
摘要：目的 应用同位素标记相对和绝对定量蛋白质组学技术(iTRAQ)筛选胚胎发育不良性神经上皮肿瘤(DNT)差异表达蛋白.方法 将DNT实体组织标本(2例)与正常脑组织标本(2例),各组标本混合后提取蛋白,进行定量和酶解.iTRAQ标记后进行液相串联质谱分析.通过Mascot软件进行图谱分析.结果 实验匹配到的谱图数量是82 300张,其中特有谱图数量为57 738张,共鉴定到2 663个蛋白,16 341个肽段,其中含14 993个特有肽段.当蛋白丰度差异倍数达到1.3倍以上,且经统计检验其P值小于0.05时,视为差异蛋白,共鉴定差异蛋白225个,其中48个蛋白上调,177个蛋白下调.结论 通过iTRAQ技术分析得到的DNT差异表达蛋白可靠,iTRAQ技术为筛选出有意义的DNT生物标记物提供了一个良好的平台.
关键词：胚胎发育不良性神经上皮肿瘤蛋白质组学同位素标记相对和绝对定量技术生物标记物
分类号：R739(肿瘤学)
资助基金：广东省科技计划(2012B031800177)
论文发表日期：2016-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：4( 506-509 )
英文信息