家族性高胆固醇血症和阿兹海默症共同的潜在基因和机制研究
吕刚1
唐燕娣2
1.武汉大学人民医院麻醉科,湖北 武汉 4300602.武汉大学人民医院老年病科,湖北 武汉 430060
摘要：目的 探讨家族性高胆固醇血症(FH)和阿尔茨海默病(AD)共同的病理生理机制.方法 从基因表达综合数据库(GEO)下载FH和AD的表达矩阵,分别为GSE13985和GSE5281.通过limma包分析鉴定共同的差异表达基因(DEG).随后对共同差异基因进行基因功能注释、蛋白质相互作用(PPI)网络、转录因子(TF)、miRNA预测和潜在药物筛选.结果 通过对GSE13985和GSE5281微阵列芯片数据重新进行差异分析,筛选得到85个共同的差异基因,其中51个上调基因,34个下调基因.基因本体(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)分析发现上述差异基因富集程度较高的条目包括氧化磷酸化、有氧呼吸和ATP代谢等.对差异基因构建PPI网络并由Cytoscape可视化,通过MCODE插件筛选出4个核心基因,包括NDUFA6、COX7B、ATP5F1C和ATP5MG.进一步发现NDUFA6、COX7B和ATP5F1C这3个核心基因存在共同的转录因子ZFP2.通过Enrichr平台对核心基因相关的小分子药物进行预测,发现1-甲基-4-苯基-2,3-二氢吡啶是得分最高的药物分子.结论 FH和AD可能存在共同的发病机制,这些共同通路和核心基因的发现为进一步探索这2种疾病的发病机制或治疗提供了新的思路.
关键词：家族性高胆固醇血症阿尔茨海默病基因芯片差异基因蛋白质相互作用网络
分类号：R592(全身性疾病)
论文发表日期：2025-08-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 66-72 )
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