汉坦病毒在锦州市啮齿动物中的携带率及基因序列分析
张振1
毛玲玲2
孙英伟2
王子江2
刘学升2
张洁2
白梅1
张旭1
姚文清2
1.锦州市疾病预防控制中心,辽宁锦州,1210002.辽宁省疾病预防控制中心,辽宁沈阳,110000
摘要:目的 研究锦州市啮齿动物中汉坦病毒(HV)的感染情况及基因分型.方法 采用间接免疫荧光法(IFA)检测鼠肺中HV抗原;阳性样品扩增汉坦病毒M片段并测序;构建系统发生树进行系统发生分析及分型.结果 2011-2013年在锦州市出血热疫区,对捕获的977只鼠进行HV抗原检测.共检出HV抗原阳性鼠肺样品43份,病毒携带率为4.40%.依据病毒分类及命名原则将43份样品分为7个毒株,每个毒株随机选取1份HV抗原阳性样品,对部分M片段进行扩增并测定序列.分析表明7株病毒与汉城病毒(SEOV)有较高的相似性,为95.6%~ 100%,而与汉滩型病毒(HTNV)相似性仅为70.2%~ 71.4%,表明7份鼠肺均携带SEOV.结论 锦州地区HV优势毒株为SEO型,其主要传染源是褐家鼠,系统进化树显示分离到7株SEO起源相同,均为S3亚型,并有明显的地区聚集性,变异较小,基因型别较为稳定.
关键词:汉坦病毒出血热带毒率系统发生分析基因分型
分类号:S443(动物危害及其防治)
资助基金:国家科技重大专项(2017ZX10103007-001)
论文发表日期:2018-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:3( 572-574 )
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ISSN:1671-2781
年,卷(期):2018,24(6)
所属栏目:生态研究