河北省鼠疫菌CRISPR基因分型及流行病学分析
周松1
杜国义1
李伟2
刘晓伟1
刘广1
王海峰1
王宇萌2
田亚汀3
陈永明1
刘合智1
史献明1
1.河北省鼠疫防治所,河北张家口0750002.中国疾病预防控制中心,北京1022003.河北北方学院,河北张家口075000
摘要：目的 对河北省鼠疫菌株进行规律聚集间隔短回文重复序列CRISPR)基因分型.方法 利用聚合酶链式反应(PCR),采用3对CRISPR引物,对河北省分离的128株鼠疫菌进行扩增,测定扩增产物核酸序列并进行分析,确定河北省菌株CRISPR基因型.结果 128株鼠疫菌在3个CRISPR位点上有8种间隔序列,包括al、a2、a3、b1、b2、c1、c2、c3,分为2个基因型.118株鼠疫菌株为Cb2型,另外10株鼠疫菌均为新基因型(命名为Cc△1型).结论 通过CRISPR分析显示河北省鼠疫菌株遗传进化比较稳定,建立了CRISPR基因库,为鼠疫菌种群遗传进化和鼠疫防控的研究提供参考.
关键词：鼠疫菌基因分型规律聚集簇间隔短回文重复序列
分类号：R378.6+1(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)
资助基金：河北省医学科学课题(20190982)河北省高等学校科学技术研究项目(QN2018212)河北省医学科学研究重点课题(ZL20140119)
论文发表日期：2020-08-20
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：3( 361-363 )
英文信息