2019年潍坊地区一株登革病毒全基因组序列分析
李东英1
霍锡元1
孙玉红2
聂清1
张作栋2
刘淑慧1
1.潍坊市疾病预防控制中心,山东 潍坊 2610612.潍坊市人民医院,山东 潍坊 261000
摘要：目的 分析2019年潍坊市一株登革病毒(Weifang 2019)全基因组序列及关键性氨基酸位点的突变情况.方法 收集登革病毒感染病例的血清样本,对初检阳性样本进行病毒分离、全基因组测序,构建进化树,对该序列进行核苷酸/氨基酸相似性分析.结果 本研究中,分别以登革病毒1型(DENV-1)参考毒株(NC_001477.1)和原型株(EU848545.1)为对照,Weifang 2019核苷酸基因组的全序列分别检出94个和95个氨基酸位点突变,其中有57个突变位点一致.其中,3个结构蛋白和7个非结构蛋白均存在突变,蛋白NS5、E和NS1位点突变占比前3位.核苷酸序列和氨基酸序列分析发现 Weifang2019 与 Guangdong 2014(99.5％/99.3％)、Wenzhou 2014(99.6％/99.4％)、Guangdong 2016(99.4％/99.2％)、Henan 2014(99.5％/99.3％)处于同一进化分支,且相似性均大于 99％.结论 2019 年潍坊地区一株登革病毒 Weifang 2019 与 Guangdong 2014(MN018287.1)、Wenzhou 2014(KR024708.1)、Guang-dong 2016(MN018286.1)和Henan 2014(KP686070.1)的遗传距离较近、相似性较高,提示Weifang 2019可能由上述地区毒株遗传进化而来.
关键词：登革热登革1型病毒E氨基酸位点关键性氨基酸
分类号：R384.1(医学寄生虫学)R184.3(流行病学与防疫)
资助基金：潍坊市卫生健康委员会课题(wfwsjk-2019-072)潍坊市卫生健康委课题(wfwsjk-2021-153)
论文发表日期：2023-06-20
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 255-259 )
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