基于DNA条形码技术的准噶尔盆地部分啮齿动物分子鉴定及三趾跳鼠遗传多样性分析
吾勒布力森·文哈尔拜1
罗勇军2
郝俊晖3
冯雷喜3
肖吾开提·塞麦提2
王启果2
贵有军2
1.新疆医科大学公共卫生学院,乌鲁木齐 8300112.新疆维吾尔自治区疾病预防控制中心,新疆维吾尔自治区预防医学科学院,乌鲁木齐 830002;新疆病媒传染病重点实验室,乌鲁木齐 8300023.新疆维吾尔自治区疾病预防控制中心,新疆维吾尔自治区预防医学科学院,乌鲁木齐 830002
摘要：目的 应用DNA条形码技术鉴定准噶尔盆地啮齿动物,分析三趾跳鼠的遗传多样性及地理种群分化特征.方法 于2024年5月采用夹夜法在准噶尔盆地捕获啮齿动物,通过形态学初步鉴定后提取基因组DNA,PCR扩增线粒体细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因并测序,结合BLAST比对、遗传距离计算和最大似然法(ML)系统发育树构建进行物种鉴定,并与传统形态学鉴定结果进行比较.利用MEGA X、DnaSP 6.0和Arlequin 3.1软件分析三趾跳鼠种群遗传多样性、单倍型分布及群体分化.结果 共捕获啮齿动物28只,其中26份样本成功扩增CO Ⅰ基因(632 bp),DNA条形码鉴定结果与形态学鉴定一致率为84.6％(22/26),4只原鉴定为柽柳沙鼠的样本经复核确认为红尾沙鼠.三趾跳鼠种群遗传分析显示,准噶尔盆地内精河县、乌苏市和石河子市种群间存在中高度遗传分化(Fst=0.114～0.751),基因流(Nm=0.083～1.937)较低;与青海、甘肃及内蒙古种群相比,分化程度更高(Fst=0.782～0.996),基因交流匮乏(Nm=0.001～0.254).错配分布分析表明三趾跳鼠种群未经历近期扩张事件.结论 DNA条形码技术可有效校正形态学鉴定的误差,为准噶尔盆地啮齿动物物种鉴定提供分子依据;准噶尔盆地的三趾跳鼠种群遗传分化显著,可能与盆地内不同区域的地理隔离及生态屏障相关,对鼠传疾病防控策略制定具有重要启示.
关键词：DNA条形码啮齿动物物种鉴定遗传多样性三趾跳鼠
资助基金：新疆维吾尔自治区自然科学基金资助项目(2021D01C126)
论文发表日期：2026-02-20
在线出版日期：2026-04-02（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 84-89 )
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