KRAS突变对人肺腺癌转录组影响的生物信息学分析
张皓旻1
陈红飞2
杨波2
迟小华3
郭斌1
席义博1
陈熙勐4
贺培凤4
卢学春2
1.030002 山西 太原,山西医科大学管理学院;100853 北京,解放军总医院第二医学中心血液科,国家老年疾病临床医学研究中心2.100853 北京,解放军总医院第二医学中心血液科,国家老年疾病临床医学研究中心3.中国人民解放军火箭军总医院药剂科, 北京,1008004.山西医科大学管理学院, 山西 太原,030002
摘要：目的 鼠肉瘤病毒致癌基因(Kirsten rat sarcoma viral oncogene,KRAS)突变型肺腺癌是临床常见肺癌亚型,发病机制不清,预后不良.推测可能与KRAS突变对整个基因组的影响有关.本研究通过对KRAS突变型肺腺癌的转录组分析,探讨其预后不良和耐药的组学机制.为研究KRAS突变型肺腺癌的发病机制和临床治疗提供指导.方法 从公共基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中下载KRAS突变型肺腺癌的转录组数据库,首先利用R语言Impute程序包进行数据标准化,然后利用Limma程序包筛选差异基因,最后利用Robust rank aggregation算法筛选显著性基因.为进一步研究其表观调控机制,我们利用R语言Clusterprofile程序包和STRING数据库分别进行了KEGG pathway分析和蛋白质互作网络分析.结果KRAS突变对全转录组影响复杂,包括改变细胞周期促进肿瘤细胞异常增殖;影响白细胞介素-17信号通路促炎反应导致免疫耐受,促进肿瘤生长;影响细胞色素P450信号通路导致耐药.结论 KRAS 突变能够引起整个基因组发生异常变化,并与促进肿瘤生长、抑制抗肿瘤免疫以及耐药相关基因的表达密切相关.
关键词：KRAS突变肺腺癌转录组生物信息学
分类号：R734.2(呼吸系肿瘤)
资助基金：国家老年疾病临床医学研究中心招标课题(NCRCG-PLAGH-2017011)解放军总医院转化医学项目(2017TM-020)解放军总医院临床科研扶持项目(2016FC-ZHCG-1004)大数据背景下医学信息管理专业人才培养模式的改革研究(重点)(J2016036)(J2016036)广东外语外贸大学校级项目(20171053)
论文发表日期：2019-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 75-79 )
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