基于数据库分析CK-19基因在乳腺癌中的表达及与患者预后相关性
殷红梅
233000 安徽 蚌埠,蚌埠医学院第一附属医院放疗科
摘要：目的 探讨肿瘤芯片数据库(Oncomine),生存分析数据库(Kaplan-Meier Plotter)和蛋白-蛋白相互作用数据库(String)平台中CK-19基因在乳腺癌中的表达及临床意义.方法 分别对Oncomine、Kaplan-Meier Plotter和String进行乳腺癌CK-19基因表达情况数据挖掘.比较乳腺癌组织和对应正常组织中CK-19 mRNA表达是否存在差异.根据CK-19高低表达情况绘制生存曲线进行CK-19与乳腺癌患者预后关系分析.同时分析CK-19蛋白共表达网路,推测CK-19可能的相互作用蛋白及其生物学功能.结果 检索Oncomine数据库发现,在乳腺癌中有9个数据集均显示乳腺癌中CK-19高表达.CK-19 mRNA聚类分析显示,CK-19 mRNA与KRT18,ERBB3,PRR5等基因mRNA存在共表达;在String蛋白互作数据库中对CK-19蛋白共表达进行了分析,结果显示CK-19与KRT8,KRT18等蛋白具有共表达关系.Oncomine数据库中,有3项基因表达芯片数据关于CK-19 mRNA在乳腺癌与正常组织中的差异表达分数数据,结果显示乳腺癌组织中CK-19 mR-NA表达水平高于正常乳腺组织(P<0.05).生存分析显示CK-19 mRNA高低表达组总生存期分别为90.0月和115.0月,差异比较无统计学意义(HR=1.14,95％CI:0.92～1.41,P=0.23),高低表达组无疾病进展生存期分别为48.16月和48.0个月,差异比较无统计学意义(HR=1.09,95％CI:0.98～1.22,P=0.11).应用String数据富集CK-19相互作用的可能相关蛋白,与CK-19相互作用的蛋白有10个,分别为作用评分均大于0.9,10个关联蛋白均属于细胞角蛋白家族,参与上皮细胞结构的稳定性.结论 CK-19 mRNA在乳腺癌组织中高表达,其蛋白与KRT18等角蛋白家族可能共同参与了上皮细胞结构的稳定性.但CK-19 mRNA高低表达与乳腺癌患者的预后无关.
关键词：乳腺癌CK-19mRNAString数据库Oncomine数据库共表达
分类号：R737.9(泌尿生殖器肿瘤)R394-33(医学遗传学)
资助基金：蚌埠医学院自然科学基金面上项目( BYKY1686)
论文发表日期：2020-08-20
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：4( 202-205 )
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