基于全转录组的心力衰竭预测标志物
马伟1
李丹丹2
张常建1
陈伟浩3
熊鸣1
乔媛媛1
李军1
1.100048 北京,解放军总医院第六医学中心2.510120 广东 广州,中山大学孙逸仙纪念医院3.100143 北京,解放军总医院第三医学中心卫勤部
摘要：目的 挖掘基于转录组的预测心力衰竭(heart failure,HF)的标志物.方法 本课题组开发了一个基于全转录组的HF预测标志物,整理转录本对应的蛋白质的氧原子含量,然后计算转录本蛋白质氧原子含量与转录本表达水平的相关性,通过随机森林模型训练预测模型.结果 对于训练集,预测模型5折交叉验证的准确率、阳性预测值和阴性预测值分别为83.6％、85.8％和81.5％.训练集的准确率、阳性预测值和阴性预测值分别为77.8％、80.0％和75.0％.在另外一个单独寻找的测试集,准确率、阳性预测值和阴性预测值分别为86.8％、86.7％和87.5％.结论 本课题组开发的基于全转录组的HF预测标志物具有非常稳定的预测性能,而且准确率高,可以用于HF预测.
关键词：心力衰竭标志物最优密码子蛋白质氧含量随机森林
分类号：R541.6(心脏、血管（循环系）疾病)
资助基金：国家自然科学基金(31500756)解放军总医院第六医学中心创新培育基金(CXPY202007)
论文发表日期：2021-12-20
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 349-353 )
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